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一个篱笆三个桩——让PCR管为您做好汉
成大业若烹小鲜-3
对于样品数量较少或有固定实验习惯的PCR/qPCR实验者而言,PCR单管和八联排管是最常用的PCR耗材选项。使用PCR管进行PCR反应,有两个操作环节是需注意的:一是反应管的有效密封(见《联排管盖操作工具在PCR实验中应用价值浅析》),二是反应管在样品模块上的支持。
所谓PCR管在反应模块上的支持,是指在样品模块上添加必要的支架、支持框类辅助器件,对PCR反应管提供固定、支撑保护,确保在反应过程中所有PCR管受热均衡,同时,均衡分摊热盖的压力,避免发生样品管变形、破损。
查阅伯乐和赛默飞PCR仪用户指南或清点货物配置清单会发现,伯乐PCR仪随机配备有Tube Support Ring/Tube Support Frame,而赛默飞PCR仪标配的PCR启动工具套件(PCR Starter kit)中提供了MicroAmp 96-Well Tray,MicroAmp 96-Well Tray /Retainer Set。这些塑料配件正是PCR反应管的支架。
了解这些支架的使用方法,将有助于充分发挥其为PCR实验的安全可靠保驾护航的作用。本文以伯乐和赛默飞PCR仪的随机附件为例,就此问题进行讨论。
归纳起来,这类PCR反应管支架可分为2种,即带盖PCR管支架和不带盖PCR管支架。
一、带盖PCR管支架
带盖PCR管支架,适用于连接有圆顶或平顶管盖的PCR单管、PCR 8联排管或12联排管。
伯乐T100、S1000、C1000 touch PCR仪配置的Tube Support Ring或Tube Support Frame,为一长方形固定框,可安装于对应的PCR反应模块上,没有固定反应管的功能,主要起平衡热盖压力的作用。
T100 PCR仪反应管支架 96孔快速PCR管支架 96×0.2mL PCR管支架
伯乐MyCycler PCR仪标配了一套上样托盘/托架(Sample Loading Tray)。这个托架底部与反应模块匹配,可直接安装固定在模块上。内部为96孔的PCR管固定网格,PCR反应管加样完成后,插入托架网格中予以固定。样品管上样结束后,即可合上热盖启动PCR。
因此,托架既是反应管的“顶天柱”-帮着扛压和防止挤压变形,又是PCR反应“守护神”,防止样品管放歪了受热不匀。可以说,MyCycler这个Sample Loading Tray的功能定位,与目前赛默飞主流的Miniamp/Miniamp Plus、Simpliamp、VeritiPro、Proflex PCR仪及Stepone Plus、Quatistudio系列实时荧光定量PCR仪标配的96孔反应管支架(MicroAmp 96-Well Tray)是异曲同工。
赛默飞PCR管支架的官方示范教程中,操作主要步骤包括:
1.1 将反应管支架安装与样品基座上;
1.2 在支架上装填PCR管并实施反应体系的准备与处理;
1.3 将PCR管-支架整体从基座上轻柔移除,整体转移至PCR反应模块上安装,可立即启动PCR程序。
二、无带盖PCR管支架
无带盖PCR管支架,即赛默飞提供的96孔固定器-托盘组合支架(96-Well Tray /Retainer Set)。
该组合支架的上部为PCR管固定器(Retainer),底部为PCR托盘(Tray),两部分可通过简单按压解锁的锁扣连接而成。组合支架适用于无管盖PCR单管或联排管。
2.1 通过向内侧挤压固定器长边卡扣解锁组合支架,将托盘与固定器分离。将托盘安装于样品准备基座(如最常用的MicroAmp Splash-Free 96-Well Base)上;
2.2 将PCR管载入托盘和构建PCR体系:根据实验样品管数量多少、样品管在PCR样品模块中排位顺序,提前组织排列PCR管,并完成PCR样品加样处理;
2.3 将固定器开孔与托盘上的反应管对齐后放下,稍微施力下压固定器的边框,将固定器与底部托盘锁紧;
2.4 PCR管密封:将联排管盖与样品孔对齐,用PCR管盖工具或徒手压盖完成反应管密封。最后组装成型的效果,从下往上依次是:托盘-PCR管-固定器-管盖;
2.5 将已密封的反应管、固定器-托盘组合支架整体安装到PCR仪样品模块上,启动PCR。
参考文献
Sample Loading Tray for the Bio-Rad MyCycler Thermal Cycler