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拨开云雾见月明——英捷iBright FL1500 Western荧光成像分析仪技术特点解析-4

iBright FL1500 蓝绿透射光源的检测应用

       Western Blot荧光成像分析仪的江湖上,伯乐ChemiDoc MP、GE Amersham ImageQuant 800 Fluor(AI800 Fluor)、耶拿UVP ChemStudio Plus和赛默飞Invitrogen iBright FL1500这四雄,要论硬件配置上最显著的区别,恐怕是非透射光源(Transilluminator)莫属。因为,伯乐、UVP的系统用了经典302nm的透射紫外台(Trans-UV);AI800 Fluor默认装备是LED透射白光(LED trans-white),当然可以选配AI800 UV升级模块;而iBright FL1500标配是一台LED蓝绿光透射仪(green-LED transilluminator)。

       很明显,GE主打Western+蛋白凝胶图像分析,Bio-Rad和UVP是要兼顾核酸、蛋白凝胶成像需求,而Thermo Fisher则意图实现凝胶类等透明样品的激发、照明多样化检测。那iBright FL1500的这一设计究竟是锐意创新的结晶,还是哗众取宠的败笔?这一问题值得探讨。

 

一、透射蓝绿色光源在核酸凝胶检测中应用的表现

       根据文献报道和厂商使用说明,对4大类核酸常用荧光染料标记凝胶成像激发方案汇总后,可获得表1所列信息。

表1 常见核酸荧光染料激发波长列表

样品类型

Trans-green (490–520nm)

Trans-UV (280–320nm)

核酸凝胶

Ethidium Bromide (EB)

● (518 nm)

●● (302 nm)

GelRed

● (488 nm)

●● (302 nm)

GelSafe

● (514 nm)

●● (309 nm)

GelGreen

●● (500 nm)

● (302 nm)

SYBR Gold

●● (495 nm)

● (302 nm)

SYBR Safe (DNA)

●● (502 nm)

● (302 nm)

SYBR Green I (dsDNA)

●● (497 nm)

● (302 nm)

SYBR Green II (RNA)

●● (497 nm)

● (302 nm)

Goldview/AO (>1 kb DNA)

●● (491 nm)

●● (294 nm)

       科研实验中不少荧光试剂,在紫外、蓝光波长下都有强度不等的吸收峰。理论上,可使用其中任何一种光源激发。

       以溴化乙锭(EB)为例,它的激发峰有两个:波长300 nm最大激发峰(主激发峰)和波长518nm次激发峰,次激发峰强度明显低于紫外波长激发峰。蓝绿光透射仪虽然可以有效激发EB,而且经1.25kb基因扩增产物琼脂糖凝胶成像对比证明,用302nm紫外光透射仪激发和基于iBright FL1500 Western成像分析仪检测,所获凝胶图像效果极其接近。                                              

iBright FL1500 蓝绿透射光源用于EB凝胶的检测.jpg


       厂商发布的荧光染料技术资料中推荐的激发波长,素有主激发峰波长、可用激发波长(次激发波长)之分。在主、次激发波长的条件下,荧光基团发光强度有差异,使得相同曝光时间内,凝胶的中、低丰度样品条带的图像信号表现可能不一致。若成像条件未经优化,为强化弱信号条带检测而延长曝光时间,不仅会引入更多图像背景噪音成份,还可能造成强信号条带过饱和,高中低信号条带强度对比失真。而基于过度曝光的图像信号定量条带样品含量,不符合ImageJ指南关于图像分析中运用朗伯-比尔定律的条件。

       一般情况下,采用荧光试剂最大激发峰波长检测,具有更好信噪比,有助于提高检测灵敏度。因此,样品丰度的定量分析应基于染料的主激发波长测定,而定性分析(如样品分子量对比鉴定)可以采用次激发波长检测。

       整体上,波长490-520 nm蓝绿光透射仪与凝胶成像分析仪标配302nm透射仪(波长范围280–320nm,辐射能量峰波长302nm),二者可激发的荧光染料种类基本重叠。

       对两种文献报道中常用的核酸相对定量分析染料SYBR Gold、SYBR Green的激发效果,蓝绿色激发光显然更优。而302nm紫外则最适于溴化乙锭EB、GelRed 和GelSafe的检测。

       Gel Safe类核酸安全无毒染料,虽兼容蓝光、紫外两种激发波长,但基因克隆实验中,蓝绿光照射可避免凝胶观察和切胶过程中,人体和样品的紫外线暴露损伤风险。故GelRed、GelSafe等染料在实际使用中,更多的是基于蓝绿光而非紫外线来检测。何况,LED光源使用寿命比紫外灯长,无须定期更换,节省管理维护成本。

       因此,核酸凝胶检测应用,iBright FL1500的490-520nm波长透射仪配置方案要优于常规紫外透射仪。

 

二、蓝绿色透射仪在蛋白检测中的应用

       生物医学实验中蛋白样品类型多样,手工和预制SDS-PAGE凝胶,常规免染型凝胶和基因克隆平板都是常用样品。

       蛋白免染凝胶荧光的应用,iBright FL1500荧光成像仪不支持伯乐的蛋白免染凝胶检测,只能使用英捷免染荧光试剂。这一点在《英捷iBright FL1500 Western荧光成像分析仪技术特点解析-2》已有讨论。

       有文献报道了用iBright FL1500 的LED蓝绿光透射仪从底部照射搭载有GFP基因的克隆培养板,对靶蛋白表达克隆进行快速筛查和克隆荧光计数分析。

表2  透射蓝光与302nm紫外激发的蛋白凝胶荧光染料对比表

样品类型

Trans-green (490–520nm)

Trans-UV (280–320nm)

蛋白凝胶

SYPRO Ruby (总蛋白)

● (460 nm)

●● (280 nm)

SYPRO Red (总蛋白)

●● (520 nm)

● (300 nm)

SYPRO Tangerine (总蛋白-WB)

●● (490 nm)

●● (300 nm)

Oriole (总蛋白)


●● (302 nm)

Flamingo火烈鸟(总蛋白)

●● (490-520 nm)


Pierce Krypton (总蛋白)

●● (520 nm)


Pro-Q Diamond (磷酸化蛋白)

●● (520 nm)


Pro-Q Emerald 300 (糖基化蛋白)


●● (302 nm)

Pro-Q Emerald 488 (糖基化蛋白)

●● (510 nm)


InVision His-tag (His标签蛋白)

●● (LED白光板替代)

●● (302 nm)

免染荧光应用

支持总蛋白定量分析

●● (英捷no-stain试剂)

●● (伯乐Stain-free胶)

菌落平板

GFP表达克隆筛查

●● (490 nm)


       表2数据显示:蛋白凝胶荧光检测应用,490-520nm蓝绿光和302nm透射仪的适用性各有千秋。用于凝胶总蛋白、翻译后修饰蛋白的定量分析的常用荧光染料检测的支持方面,两种透射光源都存在短板,难以有效覆盖全部应用。相对而言,透射蓝绿光源的兼容性更好。

       这给了我们一个有益的启示:在考虑蛋白凝胶成像分析系统配置中,如有可能,应将紫外、蓝光两种透射光源相结合,可极大提升系统蛋白凝胶检测应用的灵活性。

       iBright FL1500只能装配蓝绿透射仪,无紫透射外台可供升级。而ChemiDoc MP、UVP ChemStudio Plus可以在标配基础上加配蓝光屏或LED透射蓝光台(trans-blue),通过搭配,两种检测光源取长补短,相得益彰,实现检测功能扩展的自由。

 

三、小结

       作为一款主要定位于Western blot实验印迹荧光、化学发光ECL检测的高端成像分析仪, Invitrogen iBright FL1500通过引入蓝绿透射光源和白光板这套配置,实现了对核酸凝胶、蛋白凝胶的荧光、可见光检测分析的有效兼顾,从技术层面来说无疑非常成功。

       正所谓尺有所短寸有所长,iBright FL1500不可能是完美无缺的杰作。

       首先,在核酸凝胶检测上,由于官方只证实蓝绿透射仪可以有效支持EB标记染料的成像分析,但缺少EB染料标记核酸定量检测动态线性范围,以及这一线性范围与基于标准302nm波长检测条件下动态范围的对比数据。当用于高浓度的核酸样品(如PCR扩增产物)、低丰度样品(低表达mRNA)和稀有珍贵样品的定量分析时,若无相应验证过程,则数据可靠性难免存疑。

       其次,在蛋白凝胶检测上,iBright FL1500蓝光透射仪可支持总蛋白检测、修饰后蛋白检测,但依然存在对Oriole (总蛋白检测) 、Pro-Q Emerald 300 (糖基化蛋白检测)等染料不兼容的问题。

       此外,不支持已广泛应用的伯乐免染凝胶荧光的检测。

 

参考文献:

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