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NanoDrop Acclaro样品智能检测
分子生物学实验流程一般是对样本(组织/细胞)进行预处理后提取DNA、RNA、蛋白质等生物大分子用于下游的深度分析,比如qPCR、测序、微阵列芯片、蛋白质谱等。对生物大分子的浓度、纯度、完整性、污染物残留等进行质控对下游检测数据的准确性、客观性和重复性至关重要。比如:qPCR时,DNA模板浓度过高或过低都会影响PCR扩增效率,导致得出不够准确的定量结果;模板中残留较多的苯酚会影响PCR酶的活性甚至使酶失去活性;进行转染实验时,质粒的浓度与质量未经质控会影响细胞转染效率等。
NanoDrop One引入Thermo Scientific Acclaro样品智能技术使用精细的数学算法来分析光谱数据,自动鉴定出样品中的污染物类型,如蛋白、苯酚、胍盐、盐酸胍等。一次检测,全面分析。
样本浓度 | A260/A280纯度比值 | A260/A230纯度比值 |
样本光谱 | 纯度不达标提示 | 样本中的污染物提示 |
污染物光谱 | 矫正后样本光谱图 | 污染物的吸收值 |
矫正后的样本浓度 | 导致结果异常的原因 | 解决方案推荐 |
Acclaro智能污染物检测技术是基于依赖参考光谱库,鉴定核酸及蛋白样品中的污染物(如核酸提取过程残留的苯酚和胍盐,蛋白样品中的DNA污染),并报告校正后的浓度。若核酸样品的A260/A230比值超出可接受范围,则会被标记,并提示可能是哪些污染物导致了比值偏低。利用A205蛋白肽骨架的吸光度进行定量,可以检测蛋白样品中的DNA污染,并校正A280结果。同时,Acclaro会标记问题样品,并提供技术支持和故障排查,帮助研究人员进一步全面了解样品质量,帮助优化样本提取的实验,避免下游应用产生失误。
当检测到纯度不符合要求的样本时,软件会自动报警提示,提供可能的污染物信息,并对样本浓度进行矫正,在检测界面上可以同时查看多个样本的信息。如下图所示,Acclaro用黄色三角标识符合标记了第四号dsDNA样本可能存在污染物,提醒样本存在污染。
点击黄色三角标识,可以看到样品中存在蛋白时,导致A260值增大(蓝色光谱),从而dsDNA浓度比实际的高,污染物分析技术可将蛋白的含量(橙色光谱)从原始数据中扣除,从而得到矫正后正确的DNA浓度(绿色光谱)。
Thermo Scientific Acclaro样品智能技术,采用嵌入式传感器和数字影像分析技术,每次进行样本检测之前,对样本液柱先进行数码成像,分析液柱完整性和气泡的情况,确保检测的可靠性。